MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56D

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017485	TAT	2	6	961	966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831961
2	NC_017485	GAA	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831961
3	NC_017485	GGT	2	6	997	1002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385831961
4	NC_017485	GTG	2	6	1034	1039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385831961
5	NC_017485	ACCT	2	8	1131	1138	25 %	25 %	0 %	50 %	385831961
6	NC_017485	ATA	2	6	1143	1148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831961
7	NC_017485	A	6	6	1163	1168	100 %	0 %	0 %	0 %	385831961
8	NC_017485	T	7	7	1180	1186	0 %	100 %	0 %	0 %	385831961
9	NC_017485	TAG	2	6	1198	1203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831961
10	NC_017485	AAG	2	6	1221	1226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831961
11	NC_017485	ATG	2	6	1338	1343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831961
12	NC_017485	GTTG	2	8	1467	1474	0 %	50 %	50 %	0 %	385831961
13	NC_017485	G	6	6	1514	1519	0 %	0 %	100 %	0 %	385831961
14	NC_017485	AGA	2	6	1651	1656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831961
15	NC_017485	AAAG	2	8	1696	1703	75 %	0 %	25 %	0 %	385831961
16	NC_017485	GAA	2	6	1741	1746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831961
17	NC_017485	A	6	6	1802	1807	100 %	0 %	0 %	0 %	385831961
18	NC_017485	AGA	2	6	1813	1818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831961
19	NC_017485	AGTA	2	8	1853	1860	50 %	25 %	25 %	0 %	385831961
20	NC_017485	GTT	2	6	1867	1872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831961
21	NC_017485	ATGA	2	8	1895	1902	50 %	25 %	25 %	0 %	385831961
22	NC_017485	TAT	2	6	1903	1908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831961
23	NC_017485	AAG	2	6	2025	2030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831961
24	NC_017485	GAA	2	6	2062	2067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831961
25	NC_017485	TACC	2	8	2081	2088	25 %	25 %	0 %	50 %	385831961
26	NC_017485	TGAG	2	8	2114	2121	25 %	25 %	50 %	0 %	385831961
27	NC_017485	AAAC	2	8	2167	2174	75 %	0 %	0 %	25 %	385831962
28	NC_017485	ACAG	2	8	2210	2217	50 %	0 %	25 %	25 %	385831962
29	NC_017485	GAA	2	6	2251	2256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831962
30	NC_017485	A	8	8	2268	2275	100 %	0 %	0 %	0 %	385831962
31	NC_017485	AAAAG	2	10	2281	2290	80 %	0 %	20 %	0 %	385831962
32	NC_017485	ACAG	2	8	2301	2308	50 %	0 %	25 %	25 %	385831962
33	NC_017485	ACAG	2	8	2312	2319	50 %	0 %	25 %	25 %	385831962
34	NC_017485	A	6	6	2329	2334	100 %	0 %	0 %	0 %	385831962
35	NC_017485	CAGA	2	8	2335	2342	50 %	0 %	25 %	25 %	385831962
36	NC_017485	TTA	2	6	2377	2382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831962
37	NC_017485	AAT	2	6	2410	2415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831962
38	NC_017485	ACAG	2	8	2454	2461	50 %	0 %	25 %	25 %	385831962
39	NC_017485	AGA	2	6	2719	2724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831963
40	NC_017485	CAAT	2	8	2797	2804	50 %	25 %	0 %	25 %	385831963
41	NC_017485	A	6	6	2868	2873	100 %	0 %	0 %	0 %	385831963
42	NC_017485	AGA	2	6	2878	2883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831963
43	NC_017485	TGG	2	6	2903	2908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385831963
44	NC_017485	GAT	2	6	2926	2931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831963
45	NC_017485	AAAG	2	8	2940	2947	75 %	0 %	25 %	0 %	385831964
46	NC_017485	GAT	2	6	2977	2982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831964
47	NC_017485	ATC	2	6	3027	3032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831964
48	NC_017485	ATA	2	6	3035	3040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831964
49	NC_017485	TAAA	2	8	3092	3099	75 %	25 %	0 %	0 %	385831964
50	NC_017485	TC	3	6	3104	3109	0 %	50 %	0 %	50 %	385831964
51	NC_017485	TGA	2	6	3117	3122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831964
52	NC_017485	ACA	2	6	3149	3154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831964
53	NC_017485	A	6	6	3183	3188	100 %	0 %	0 %	0 %	385831964
54	NC_017485	GAA	2	6	3348	3353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831964
55	NC_017485	TCA	2	6	3365	3370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831964
56	NC_017485	T	6	6	3472	3477	0 %	100 %	0 %	0 %	385831965
57	NC_017485	TTA	2	6	3500	3505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831965
58	NC_017485	ATT	2	6	3517	3522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831965
59	NC_017485	T	6	6	3521	3526	0 %	100 %	0 %	0 %	385831965
60	NC_017485	T	6	6	3539	3544	0 %	100 %	0 %	0 %	385831965
61	NC_017485	ATA	2	6	3552	3557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831965
62	NC_017485	TTTA	2	8	3558	3565	25 %	75 %	0 %	0 %	385831965
63	NC_017485	AAT	2	6	3574	3579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831965
64	NC_017485	AAC	2	6	3660	3665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831965
65	NC_017485	TTA	2	6	3669	3674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831965
66	NC_017485	AG	3	6	3725	3730	50 %	0 %	50 %	0 %	385831965
67	NC_017485	A	7	7	3757	3763	100 %	0 %	0 %	0 %	385831965
68	NC_017485	A	6	6	3771	3776	100 %	0 %	0 %	0 %	385831965
69	NC_017485	A	6	6	3778	3783	100 %	0 %	0 %	0 %	385831965
70	NC_017485	AAT	2	6	3911	3916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831966
71	NC_017485	TTG	2	6	3954	3959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831966
72	NC_017485	TTA	2	6	3960	3965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831966
73	NC_017485	TAA	2	6	3975	3980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831966
74	NC_017485	GTT	2	6	4073	4078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831966
75	NC_017485	T	7	7	4124	4130	0 %	100 %	0 %	0 %	385831966
76	NC_017485	TAT	2	6	4237	4242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831966
77	NC_017485	TTA	2	6	4265	4270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831966
78	NC_017485	ATGG	2	8	4291	4298	25 %	25 %	50 %	0 %	385831966
79	NC_017485	A	6	6	4346	4351	100 %	0 %	0 %	0 %	385831966
80	NC_017485	TTC	2	6	4518	4523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831967
81	NC_017485	ACT	2	6	4564	4569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831967
82	NC_017485	GTC	2	6	4587	4592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385831967
83	NC_017485	GTGA	2	8	4637	4644	25 %	25 %	50 %	0 %	385831967
84	NC_017485	CAAA	2	8	4693	4700	75 %	0 %	0 %	25 %	385831967
85	NC_017485	A	6	6	4719	4724	100 %	0 %	0 %	0 %	385831967
86	NC_017485	CAA	2	6	4760	4765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831967
87	NC_017485	CATG	2	8	4781	4788	25 %	25 %	25 %	25 %	385831967
88	NC_017485	CAA	2	6	4796	4801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831967
89	NC_017485	TTA	2	6	4997	5002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831967
90	NC_017485	AATG	2	8	5091	5098	50 %	25 %	25 %	0 %	385831967
91	NC_017485	AACA	2	8	5227	5234	75 %	0 %	0 %	25 %	385831968
92	NC_017485	GA	3	6	5241	5246	50 %	0 %	50 %	0 %	385831968
93	NC_017485	T	6	6	5247	5252	0 %	100 %	0 %	0 %	385831968
94	NC_017485	GTTC	2	8	5253	5260	0 %	50 %	25 %	25 %	385831968
95	NC_017485	A	6	6	5275	5280	100 %	0 %	0 %	0 %	385831968
96	NC_017485	GAA	3	9	5295	5303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831968
97	NC_017485	T	7	7	5313	5319	0 %	100 %	0 %	0 %	385831968
98	NC_017485	CTT	2	6	5320	5325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831968
99	NC_017485	AAAG	2	8	5338	5345	75 %	0 %	25 %	0 %	385831968
100	NC_017485	ATTTT	2	10	5357	5366	20 %	80 %	0 %	0 %	385831968
101	NC_017485	TGT	2	6	5536	5541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831968

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.